Na tela de MATERIAIS > Tributos, selecione o registro do tributo na qual você queira que os impostos sejam retidos na nota fiscal e se dirija até a aba “Op. de Saída Geral/Serviços” no cadastro deste tributo:
Nesta aba ao lado dos campos para informar a porcentagem dos impostos de PIS, COFINS, INSS, CSLL e IRRF, há a flag “Reter na nota”, ao ser marcada o imposto correspondente será retido na nota fiscal, (deve ser configurado em cada sub aba).